微生物檢測是食品、農產品的重要檢測項目，餐飲業、加工食品的微生物指標都需要達到標準，否則將危害人類健康。英倫檢測分析中心在微生物檢測領域擁有豐富的經驗，微生物實驗室潔凈度可達百級，可以對非致病菌進行檢測； 同時還可進行食源性致病菌的檢測。
檢測項目：
| 非致病性菌： | 菌落總數、大腸菌群、大腸桿菌、乳酸菌、霉菌和酵母菌； |
| 食源性致病菌： | 大腸埃希氏菌、沙門氏菌、志賀氏菌、金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌、單核細胞增生李斯特氏菌、副溶血性弧菌等； |
| 生物酶素： | 黃曲霉素M1、B1、B2、G1、G2、嘔吐毒素、赭曲霉毒素A、T-2霉素、玉米赤霉烯酮、微囊藻毒素-LR； |
| 硝酸鹽類： | 硝酸鹽、亞硝酸鹽； |
| 重金屬類： | 鎘Cd、鉻Cr、鉛Pb、砷As、汞Hg、重金屬總量等； |
| 其它毒害： | 丙烯酰胺、二甲基亞硝胺、二乙基亞硝胺、六氯苯、烷基汞等； |